Bir sulama sisteminin kurulduktan sonra işlevini ilk günkü gibi sorunsuz yerine getirebilmesi sistemdeki filtrelerin doğru seçilip monte edilmesine bağlıdır. Aksi halde özellikle damla sulama sistemlerinde tıkanan damlatıcıları açmak için ekstra maliyetlere katlanmak zorunda kalınacak fark edilmeyen tıkanmalar bitkilerin strese girmesine ve ürün kaybına yol açacaktır.
Suda kirliliği oluşturan partiküle göre filtre tipi, sistem debisine göre filtre boyutları doğru seçilmelidir. Örneğin yosun için kumlu gravel filtreler, kum için hidrosiklon filtreler, disk filtreler ve bunların bir bütün olarak kullanıldığı filtre sistemleri.
Sık tıkanma olan kirli sularda sulama rejimini aksatmadan sistemin çalışmaya devam edebilmesi için otomatik ters yıkamalı filtreler tercih edilmelidir.